เมื่อวันที่ 13 ก.ค.68 ผู้สื่อข่าวรายงานว่า พระเทพพัชราภรณ์ เจ้าอาวาสวัดชูจิตธรรมาราม ได้ทำหนังสือถึง พระราชวชิรสารสุธี เจ้าคณะจังหวัดพระนครศรีอยุธยา (ธรรมยุต) เรื่อง ขอลาออกจากการเป็นเจ้าอาวาสวัดชูจิตธรรมาราม พระอารามหลวง ความว่า

ตามที่มหาเถรสมาคม (มส.) ได้มีมติในการประชุมครั้งที่ 20/2555 เมื่อวันที่ 10 กันยายน 2555 แต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่ง เจ้าอาวาสวัดชูจิตธรรมาราม ต.สนับทึบ อ.วังน้อย จ.พระนครศรีอยุธยา ตั้งแต่วันที่ 14 กันยายน 2555 ความแจ้งแล้วนั้น เนื่องจากกระผมได้ตกเป็นข่าวด้านลบทางสื่อสารมวลชน ทำให้เกิดความเสื่อมเสียต่อวัดและหมู่คณะสงฆ์เป็นอย่างมาก ดังนั้น กระผมจึงขอลาออกจากการเป็นเจ้าอาวาสวัดชูจิตธรรมาราม พระอารามหลวง เพื่อเข้าสู่กระบวนการตรวจสอบความจริง ต่อไป ตั้งแต่วันที่ 13 กรกฎาคม 2568

จึงขอกราบเรียนมาเพื่อโปรดพิจารณาดำเนินการต่อไป 

ทั้งนี้ พระราชวชิรสารสุธี เจ้าคณะจังหวัดพระนครศรีอยุธยา (ธรรมยุต) ได้มีคำสั่งแต่งตั้งให้ พระเทพวชิรกิตติ ผู้ช่วยเจ้าอาวาสวัดโสมนัสวิหาร รองเจ้าคณะภาค 1-2-3 (ธรรมยุต) ดำรงตำแหน่งผู้รักษาการแทนเจ้าอาวาสวัดชูจิตธรรมาราม